Evolutionäre und Ökologische Genomik

Wir befassen uns mit evolutionären und ökologischen Fragen in der integrierten Biologie, indem wir neuartige Genomikwerkzeuge und maschinelles Lernen nutzen. Zu unseren Interessen gehören die Robustheit polyploider Arten, die Evolution der Sprache, die Evolution von Paarungssystemen sowie die Genexpression und Bildanalyse unter natürlich schwankenden Bedingungen in natura. Wir entwickeln neue Bioinformatik-Tools (z.B. HomeoRoq für die polyploide RNA-seq), Tools für maschinelles Lernen (z. B. PlantServation) zur Analyse quantitativ grosser Datenmengen, die sowohl im Labor als auch in der Natur gewonnen wurden, sowie Datenbanken (z. B. GeLaTo, GEnes and LAnguages TOgether). Zu unseren Studienarten gehören Arabidopsis-Verwandte als Modellarten, Weizen als Kulturpflanze, tropische Bäume als umweltrelevante Arten und der Mensch. Wir freuen uns über neue Mitglieder mit neuen Ansätzen und Spezies.

Gruppenleitung: Prof. Dr. Kentaro K. Shimizu

Laufende Projekte

• Evolution von Selbst-Kompatibilität in Arabidopsis thaliana durch eine Mutation im männlichen Spezifitäts-Gen
• Vorhersage des Expressionslevels des Blütengens in natürlich fluktuierender Umwelt
• Netzwerkanalysen der Funktionen in duplizierten Genomen von erst kürzlich hybridisierten Arten
• Genetische, epigenetische und populationsgenetische Folgen von Artenbildung durch Genomduplikation (Polyploidisation)
• Molekulare Populationsgenetik tropischer Bäume
• Genomduplikationen in Mollusken
• Bakterielle Aktivitäten in der insektenfressenden Kannenpflanze Nepenthes

Unsere Forschungsprojekte sind hier beschrieben: Forschungsdatenbank der Universität Zürich.

Neuigkeiten

• 30. August 2024. Team-Anlass.
• 01. September 2023. Lab Ausflug.
• 22. November 2022. Genes and Languages
• UZH News: English German
• 03. August 2022. Global Spread of Powdery Mildew through Migration and Trade
  UZH News: English German
• 01. November 2021. Former Post-doctoral fellow Hiroyuki Kakui received "The Presentation award of the 140th meeting of the Japanese Society of Breeding" at the 140th meeting of the Japanese Society of Breeding.
  Link
• 25. November 2020. Wheat Diversity Due to Cross-Hybridization with Wild Grasses
  UZH News: English German
• 06. Oktober 2020. Evolution in Action: New Plant Species at Urnerboden
  UZH News: English German
• 08. Juni 2020. Newly Identified Gene Reduces Pollen Number of Plants
  UZH News: English German